Wabah virus corona makin melebar ke hampir seluruh negara.

Virus Corona adalah sekeluarga virus yang menyebabkan penyakit pada mamalia dan burung. Pada manusia, virus corona menyebabkan infeksi saluran pernapasan yang biasanya ringan, seperti flu biasa, meskipun bentuk yang lebih jarang seperti SARS, MERS dan COVID-19 dapat mematikan.

Gejala bervariasi pada spesies lain: pada ayam, mereka menyebabkan penyakit saluran pernapasan atas, sedangkan pada sapi dan babi mereka menyebabkan diare. Tidak ada vaksin atau obat antivirus untuk mencegah atau mengobati infeksi coronavirus manusia.

Coronavirus terdiri dari Orthocoronavirinae subfamili dalam keluarga Coronaviridae, sesuai urutan Nidovirales. Mereka adalah virus yang diselimuti dengan genom RNA untai tunggal indra positif dan nukleokapsid simetri heliks. Ukuran genom dari coronavirus berkisar dari sekitar 27 hingga 34 kilobase, yang terbesar di antara virus RNA yang dikenal.

Nama coronavirus berasal dari bahasa Latin corona, yang berarti “mahkota” atau “halo”, yang mengacu pada penampilan karakteristik partikel virus (virion): mereka memiliki pinggiran yang mengingatkan pada mahkota atau korona matahari.

Penemuan Coronavirus

Virus korona ditemukan pada 1960-an. Yang paling awal ditemukan adalah virus infeksi bronkitis pada ayam dan dua virus dari rongga hidung pasien manusia dengan flu biasa yang kemudian dinamai human coronavirus 229E dan human coronavirus OC43. Anggota keluarga virus corona lain sejak itu telah diidentifikasi, termasuk SARS-CoV pada 2003, HCoV NL63 pada 2004, HKU1 pada 2005, MERS-CoV pada 2012, dan SARS-CoV-2 (sebelumnya dikenal sebagai 2019-nCoV) pada 2019; sebagian besar dari strain ini telah terlibat dalam infeksi saluran pernapasan yang serius.

Apa yang Dimaksud Virus?

Virus adalah organisme hidup yang memiliki ukuran penampang lebih kecil dari 1 mikrometer. Sedangkan kuman dan bakteri memiliki ukuran di atas 1 mikron, sehingga lebih mudah diamati (dibanding virus) menggunakan mikroskop biasa.

Taksonomi Coronavirus

Nama ilmiah untuk coronavirus adalah Orthocoronavirinae atau Coronavirinae. Coronavirus milik keluarga Coronaviridae.

Genus: Alphacoronavirus

Spesies: Human coronavirus 229E, Human coronavirus NL63, kelelawar Miniopterus coronavirus 1, Kelelawar Miniopterus coronavirus HKU8, Virus diare diare epidemi, Kelelawar virus coronavirus HKU2 kelelawar, Kelelawar Scotolilus HKU2, Kelelawar koreptor Scotophilus HKU2

Genus Betacoronavirus; jenis spesies: Murine coronavirus

Spesies: Betacoronavirus 1, Human coronavirus HKU1, Murine coronavirus, Pipistrellus bat coronavirus HKU5, Rousettus bat coronavirus HKU9, Koronavirus terkait sindrom pernafasan akut, coronavirus kelelawar sindrom Tylonycteris koronavirus HKU4, coronavirus terkait dengan koronavirus HKU4, Koronavirus terkait dengan virus Timur Tengah, coronavirus virus HP43 (EriCoV)

Genus Gammacoronavirus; jenis spesies: Virus bronkitis infeksiosa

Spesies: Paus beluga coronavirus SW1, Virus bronkitis infeksiosa

Genus Deltacoronavirus; jenis spesies: Bulbul coronavirus HKU11

Spesies: Bulbul coronavirus HKU11, Porcine coronavirus HKU15

Evolusi Virus Corona

Nenek moyang bersama terbaru (MRCA) dari semua coronavirus diperkirakan telah ada pada sekitar tahun 8000 Sebelum Masehi. MRCA dari garis Alphacoronavirus telah diperkirakan muncul pada sekitar tahun 2400 Sebelum Masehi, garis Betacoronavirus pada 3300 SM, garis Gammacoronavirus pada 2800 SM, dan garis Deltacoronavirus sekitar 3000 SM. Tampaknya kelelawar dan burung, sebagai vertebrata terbang berdarah panas, adalah inang yang ideal untuk sumber gen coronavirus (dengan kelelawar untuk Alphacoronavirus dan Betacoronavirus, dan burung untuk Gammacoronavirus dan Deltacoronavirus) untuk memicu evolusi dan penyebaran virus coronavirus.

Bovine coronavirus dan coronavirus pernapasan anjing menyimpang dari leluhur bersama pada tahun 1951.  Bovine coronavirus dan human coronavirus OC43 menyimpang sekitar tahun 1890-an. Bovine coronavirus menyimpang dari spesies coronavirus kuda pada akhir abad ke-18.

MRCA human coronavirus OC43 telah ada sejak tahun 1950-an.

MERS-CoV, meskipun terkait dengan beberapa spesies kelelawar coronavirus, tampaknya telah menyimpang dari ini beberapa abad yang lalu. Human coronavirus NL63 dan kelelawar coronavirus berbagi MRCA 563–822 tahun yang lalu.

Virus korona kelelawar yang paling dekat hubungannya dan SARS-CoV menyimpang pada tahun 1986. Para peneliti memperkirakan coronavirus telah bersama-sama hidup dengan kelelawar untuk waktu yang lama dan nenek moyang SARS-CoV pertama kali menginfeksi spesies genus Hipposideridae, kemudian menyebar ke spesies Rhinolophidae dan kemudian ke musang, dan akhirnya ke manusia.

Virus korona manusia

Virus corona diyakini menyebabkan proporsi yang signifikan dari semua pilek yang terjadi pada orang dewasa dan anak-anak. Virus corona menyebabkan pilek dengan gejala-gejala utama demam dan sakit tenggorokan akibat pembengkakan kelenjar gondok, terutama di musim dingin dan awal musim semi.

Coronavirus dapat menyebabkan pneumonia. Pneumonia virus langsung atau pneumonia bakteri sekunder. Virus ini bisa menyebabkan bronkitis ; bronkitis virus langsung atau bronkitis bakteri sekunder.

Human coronavirus yang banyak dipublikasikan ditemukan pada tahun 2003, SARS-CoV, yang menyebabkan sindrom pernafasan akut yang parah (SARS). SARS memiliki patogenesis yang unik karena menyebabkan infeksi saluran pernapasan bagian atas dan bawah. Tidak ada vaksin atau obat antivirus untuk mencegah atau mengobati infeksi coronavirus manusia.

Tujuh jenis virus korona yang menyerang manusia :

  • Human coronavirus 229E (HCoV-229E)
  • Human coronavirus OC43 (HCoV-OC43)
  • Koronavirus sindrom pernapasan akut (SARS-CoV)
  • Human coronavirus NL63 (HCoV-NL63, New Haven coronavirus)
  • Human coronavirus HKU1
  • Coronavirus terkait sindrom pernafasan Timur Tengah (MERS-CoV), yang sebelumnya dikenal sebagai novel coronavirus 2012 dan HCoV-EMC
  • Sindrom pernapasan akut akut coronavirus 2 (SARS-CoV-2), sebelumnya dikenal sebagai 2019-nCoV atau “novel coronavirus 2019”

Coronavirus HCoV-229E, -NL63, -OC43, dan -HKU1 terus beredar dalam populasi manusia dan menyebabkan infeksi pernafasan pada orang dewasa dan anak-anak di seluruh dunia.

Wabah penyakit terkait coronavirus

  • Sindrom pernapasan akut berat SARS (Severe acute respiratory syndrome)

Pada tahun 2003, setelah berjangkitnya sindrom pernafasan akut yang parah (SARS) yang telah dimulai tahun sebelumnya di Asia, dan kasus sekunder di tempat lain di dunia, Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) mengeluarkan siaran pers yang menyatakan bahwa virus corona baru diidentifikasi oleh sejumlah laboratorium adalah agen penyebab SARS. Virus ini secara resmi bernama SARS coronavirus (SARS-CoV). Lebih dari 8.000 orang terinfeksi, sekitar 10% di antaranya meninggal.

  • Sindrom pernapasan Timur Tengah MERS (Middle East respiratory syndrome)

Pada bulan September 2012, jenis baru coronavirus diidentifikasi, awalnya disebut Novel Coronavirus 2012, dan selanjutnya secara resmi bernama Middle East syndrome sindrom pernafasan (MERS-CoV). Organisasi Kesehatan Dunia mengeluarkan peringatan global segera setelah itu.

Pembaruan WHO pada 28 September 2012 menyatakan bahwa virus itu tampaknya tidak mudah menular dari orang ke orang. Namun, pada 12 Mei 2013, kasus penularan dari manusia ke manusia di Prancis dikonfirmasi oleh Kementerian Sosial dan Kesehatan Prancis.

Selain itu, kasus penularan dari manusia ke manusia dilaporkan oleh Kementerian Kesehatan di Tunisia. Dua kasus dikonfirmasi melibatkan orang-orang yang tampaknya telah menangkap penyakit dari almarhum ayah mereka, yang menjadi sakit setelah kunjungan ke Qatar dan Arab Saudi.

Meskipun demikian, tampaknya virus tersebut memiliki masalah penyebaran dari manusia ke manusia, karena kebanyakan orang yang terinfeksi tidak menularkan virus. Pada 30 Oktober 2013, ada 124 kasus dan 52 kematian di Arab Saudi.

Setelah Pusat Medis Erasmus Belanda mengurutkan virus, virus diberi nama baru, Human Coronavirus-Erasmus Medical Center (HCoV-EMC). Nama terakhir untuk virus ini adalah coronavirus syndrome pernapasan Timur Tengah (MERS-CoV).

Pada Mei 2014, dua kasus infeksi MERS-CoV di Amerika Serikat telah dicatat. Keduanya terjadi pada petugas layanan kesehatan yang bekerja di Arab Saudi, dan kemudian melakukan perjalanan ke A.S. Satu dirawat di Indiana dan satu di Florida. Kedua individu ini dirawat di rumah sakit sementara dan kemudian dipulangkan.

Pada Mei 2015, wabah MERS-CoV terjadi di Republik Korea, ketika seorang pria yang telah melakukan perjalanan ke Timur Tengah, mengunjungi 4 rumah sakit di daerah Seoul untuk mengobati penyakitnya. Ini menyebabkan salah satu wabah MERS-CoV terbesar di luar Timur Tengah. Pada Desember 2019, 2.468 kasus infeksi MERS-CoV telah dikonfirmasi oleh tes laboratorium, 851 di antaranya fatal, angka kematian sekitar 34,5%.

  • Penyakit Coronavirus 2019 (COVID-19) atau Novel Coronavirus

Pada Desember 2019, wabah pneumonia dilaporkan di Wuhan, Cina. Pada tanggal 31 Desember 2019, wabah itu ditelusuri ke jenis virus corona baru, yang diberi nama sementara 2019-nCoV oleh Organisasi Kesehatan Dunia (WHO), kemudian berganti nama menjadi SARS- CoV-2 oleh Komite Internasional tentang Taksonomi Virus. Beberapa peneliti telah menyarankan bahwa Pasar Makanan Laut Huanan mungkin bukan sumber asli penularan virus ke manusia.

Pada 24-25 Februari 2020, telah ada 2.629 kematian yang dikonfirmasi dan lebih dari 79.700 kasus yang dikonfirmasi dalam wabah pneumonia koronavirus. Strain Wuhan telah diidentifikasi sebagai strain baru Betacoronavirus dari grup 2B dengan ~ 70% kesamaan genetik dengan SARS-CoV. Virus ini memiliki 96% kesamaan dengan coronavirus kelelawar, sehingga diduga berasal dari kelelawar.

Virus Corona Pada Hewan

Virus corona terutama menginfeksi saluran pernapasan bagian atas dan saluran pencernaan mamalia dan burung. Mereka juga menyebabkan berbagai penyakit pada hewan ternak dan peliharaan peliharaan, beberapa di antaranya bisa serius dan merupakan ancaman bagi industri pertanian. Pada ayam, virus infeksi bronkitis (IBV), virus corona, menargetkan tidak hanya saluran pernapasan tetapi juga saluran urogenital. Virus ini dapat menyebar ke berbagai organ di seluruh ayam. Coronavirus yang signifikan secara ekonomi pada hewan ternak termasuk porcine coronavirus (transmissible gastroenteritis coronavirus, TGE) dan bovine coronavirus, yang keduanya mengakibatkan diare pada hewan muda. Feline coronavirus: dua bentuk, feline enteric coronavirus adalah patogen dengan signifikansi klinis kecil, tetapi mutasi spontan dari virus ini dapat mengakibatkan infeksi peritonitis pada kucing (FIP), penyakit yang berhubungan dengan kematian tinggi.

Demikian pula, ada dua jenis coronavirus yang menginfeksi musang: ferret enteric coronavirus menyebabkan sindrom gastrointestinal yang dikenal sebagai epizootic catarrhal enteritis (ECE), dan versi virus sistemik yang lebih mematikan (seperti FIP pada kucing) yang dikenal sebagai ferret systemic coronavirus (FSC ). Ada dua jenis canine coronavirus (CCoV), satu yang menyebabkan penyakit gastrointestinal ringan dan satu yang ditemukan menyebabkan penyakit pernapasan.

Mouse hepatitis virus (MHV) adalah virus korona yang menyebabkan penyakit epidemi murine dengan mortalitas tinggi, terutama di antara koloni tikus laboratorium. Sialodacryoadenitis virus (SDAV) adalah virus corona yang sangat menular dari tikus laboratorium, yang dapat ditularkan antara individu melalui kontak langsung dan tidak langsung dengan aerosol. Infeksi akut memiliki morbiditas dan tropisme yang tinggi untuk kelenjar liur, lachrymal, dan harderian.

Virus korona kelelawar terkait HKU2 yang disebut coronavirus sindrom diare akut babi (SADS-CoV) menyebabkan diare pada babi.

Sebelum penemuan SARS-CoV, MHV telah menjadi coronavirus yang paling banyak dipelajari baik in vivo dan in vitro maupun di tingkat molekuler. Beberapa strain MHV menyebabkan ensefalitis demielinasi progresif pada tikus yang telah digunakan sebagai model murine untuk multiple sclerosis. Upaya penelitian yang signifikan telah difokuskan pada menjelaskan patogenesis virus dari coronavirus hewan ini, terutama oleh ahli virus yang tertarik pada penyakit hewan dan zoonosis.